Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms