Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms