Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms