Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP13Q92995 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP13Q92995 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP13Q92995 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP13Q92995 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP13Q92995 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP13Q92995 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP13Q92995 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP13Q92995 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP13Q92995 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP13Q92995 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP13Q92995 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP13Q92995 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP13Q92995 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP13Q92995 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP13Q92995 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP13Q92995 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP13Q92995 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms