Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRF1Q92994 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRF1Q92994 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms