Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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