Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF4Q8WXU2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms