Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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