Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPIRE2Q8WWL2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIRE2Q8WWL2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms