Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms