Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WHAMMQ8TF30 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms