Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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