Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00301Q8NCQ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms