Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC2Q8NBF2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms