Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38AQ8NAV1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms