Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM199Q8N511 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms