Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLIP4Q8N3C7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLIP4Q8N3C7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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