Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD4Q8IYR2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms