Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms