Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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