Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms