Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms