Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms