Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HECW1Q76N89 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms