Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM5Q71RC9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms