Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP31Q70CQ4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms