Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM136Q6ZRR5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms