Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LIAT1Q6ZQX7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms