Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP29

PQLC2, Lysosomal amino acid transporter 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2Q6ZP29 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PQLC2Q6ZP29 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms