Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFXL1Q6ZNB6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms