Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms