Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT2Q6UVM3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT2Q6UVM3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms