Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A47Q6Q0C1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A47Q6Q0C1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms