Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1Q6PKG0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms