Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms