Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ANKRD40Q6AI12 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms