Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms