Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf57Q5W0N0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms