Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms