Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms