Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUSD4Q5VX71 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms