Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms