Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOCADQ5VW36 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms