Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GFI1BQ5VTD9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFI1BQ5VTD9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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