Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms