Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BEND3Q5T5X7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BEND3Q5T5X7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms