Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms