Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms