Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KHDC3LQ587J8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms