Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms